生物產業除了傳統農林漁牧產品外，在生物材料、生物醫學工程等方面都具有極大的發展潛力。因應未來生物產業的發展，跨領域整合的生物機電工程人才的重要性將與日俱增。未來本系將兼顧傳統的生物生產、處理、利用和新興的生物技術等產業需求，繼續發展生物生產機械與自動化、生物環境系統監控、生物材料、生物信號處理、智慧型控制等生物機電整合科技發展。本系所培養畢業生將可進入全國各生物產業研發、生產、管理運銷相關公司或研究機構擔任技術或研發部門工作，亦可在工業界從事車輛、機械、食品加工、自動化及生物醫學工程等相關行業。

本職涯進路圖的建置，有助於學生了解未來之發展，強化就業競爭力。